A pesar de estar a sólo treinta millas al norte del ecuador, la temperatura a estas alturas puede ser bastante fría por la noche cuando las nubes y la lluvia llegan. La temperatura generalmente fluctúa entre 16°C y 25°C. El noroeste de Ecuador es uno de los climas más húmedos de la Tierra. La estación más seca suele ser de julio a octubre. La alta pluviosidad y el 100% de humedad durante gran parte del día son fundamentales para las comunidades vegetales y animales que han evolucionado en estos bosques. Aquí se superponen la flora y la fauna de las regiones centroamericana, amazónica y andina, creando una de las zonas con mayor diversidad biológica del planeta.

Se estima que hay más de 400 especies de aves en la reserva, con 358 especies registradas hasta junio de 2020. Algunas de las aves más amenazadas de Ecuador, como el águila andina, en peligro crítico, se encuentran aquí, así como tangaras, halcones, loros, búhos y tucanes, por nombrar sólo algunos. Más de una docena de especies de colibríes zumban por todo el bosque, algunos de ellos de apenas un centímetro de longitud. El impresionante Pájaro paraguas, el Gallito de la peña, el Tucán Barbudo y el colorido Quetzal de Cabeza Dorada también tienen su hogar en esta reserva.

La evidencia en forma de excrementos, huellas y avistamientos ocasionales brindan la seguridad de que nuestras seis especies de felinos deambulan por sus territorios aquí en la reserva. Los nombres comunes son jaguarundi, tigrillo, ocelote, oncilla, puma y la subespecie occidental de jaguar. Por la mañana, junto con el coro de pájaros, es probable que lo despierte el mono aullador de manto ecuatoriano. Es el más ruidoso, por lo que a menudo se le puede oír y, a veces, ver en el dosel. Los otros dos primates son los capuchinos de cabeza blanca y el mono araña de cabeza marrón, en peligro crítico de extinción. La única especie de oso sudamericano, el oso de anteojos, habita en las elevaciones más altas de la reserva y se lo ve en ocasiones.

Lista de especies iNaturalist